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1. 1997-2007年连续被评定为江苏省一级期刊
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2. 1995年被评为江苏省高校优秀自然科学学报
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3. 1997年被评为江苏省优秀期刊
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4. 1999年被评为江苏省优秀期刊
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5. 1999年被评为江苏省高校优秀自然科学学报
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6. 2000年获中国学术期刊(光盘版)《CAJ-CD规范》执行优秀奖
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7. 2007年被评为江苏省优秀期刊
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8. 2007年获江苏省期刊封面设计三等奖
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9. 2009年度“数学学科”获“明珠奖”特色栏目奖
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10. 2009年度获优秀编辑质量奖
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11. 2011年获全国高师学报系统“十佳学报”
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12. 2013年荣获全国高师学报系统“高校学科建设贡献奖”
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13. 2014年第六届江苏科技期刊“优秀期刊·特色期刊奖”
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14. 2016年度中国高校编辑出版质量优秀科技期刊
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15. 2016年度“淮海研究”栏目获江苏科技期刊“创意策划奖·十佳品牌栏目奖”
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16. 2017年度“淮海研究”栏目获江苏期刊“明珠奖”特色栏目奖
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17. 2018,2020,2022年度被中国高校科技期刊研究会评为中国高校优秀科技期刊
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18. 2007年至今连续被评为中国科技核心期刊
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19. 2019,2020年，SCD来源期刊
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20. 2020被评为“RCCSE中国核心学术期刊”
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21. 2020年度，“甘薯生物学与产业技术”栏目被评为江苏期刊“明珠奖”优秀栏目
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22. 2020年度，“甘薯生物学与产业技术”栏目获江苏省科技期刊“金马奖”十佳品牌栏目奖
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23. 2021年度江苏省高校优秀期刊
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24. 2023年度江苏省高校特色期刊
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25. 2024年，“甘薯生物学与产业技术”栏目被评为江苏期刊“明珠奖”优秀栏目"
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26. 2024年，“甘薯生物学与产业技术”栏目被评为第七届华东地区期刊“优秀栏目”